《世界自然保护联盟》（IUCN）红色名录中2003年将昆明鲇列为濒危（EN），而在2008年已更改为极危（CR）。

《中国物种红色名录》和《中国濒危动物红皮书 鱼类》中均将昆明鲇列为濒危（EN）。