昆明鲇原为滇池常见鱼类，为食用经济鱼类之一。由于产地周边人口急骤增多，大量生活污水泄入湖内，使湖水富营养化；其次工业废水注入湖中造成水质恶化，再则长期过度捕捞；同时，湖中引种带入一些其它鱼类等因素，使昆明鲇的种群数量急剧减少。自1970年代以来已几乎绝迹。